در پاسخ به حملات اسرائیل، ایران حملات تلافی‌جویانه موشکی و پهپادی را آغاز کرد. در ۱۳ و ۱۴ ژوئن، ایران شش موج حمله را با استفاده از ۱۰۰ تا ۲۰۰ موشک انجام داد. همزمان، حوثی‌ها حداقل سه حمله پهپادی و موشکی را به اسرائیل انجام دادند.

در ۲۱ ژوئن ۲۰۲۵، آمریکا مستقیماً به اسرائیل، در حملات علیه ایران پیوست. دونالد ترامپ، رئیس‌جمهور آمریکا، اعلام کرد که نیروهای آمریکا سه سایت هسته‌ای ایران (فردو، نطنز و اصفهان) را هدف قرار داده‌اند و مدعی شد که تأسیسات بسیار مستحکم فردو «نابود شده است».

گزارش‌ها حاکی از استفاده از بمب‌افکن‌های B-2 و بمب‌های سنگرشکن ۳۰,۰۰۰ پوندی آمریکا بوده است. این بدان معنی است که آمریکا توانایی و تهدیدهای ایران را به‌اندازه‌ای جدی ارزیابی کرده است که مداخله نظامی مستقیم را، با وجود خطرات عظیم درگیری منطقه‌ای، توجیه می‌کند. این اقدام همچنین نشان‌دهنده یک استراتژی هماهنگ با اسرائیل برای دستیابی به اهدافی مانند نابودی تأسیسات هسته‌ای صلح‌جویانه است که اسرائیل به‌تنهایی قادر به انجام آن‌ها نیست.

حملات ایران تا بامداد 24 ژوئن و دقایقی پس از اعلام نهایی آتش‌بس ادامه یافت و چند موج جداگانه از موشک‌ها و پهپادها را علیه اسرائیل شلیک کرد. حملات گسترده جمهوری اسلامی ایران هیمنه پوشالی پدافند اسرائیل را درهم شکست. پدافند گنبد آهنین، فلاخن داود و تاد از حیّز انتفاع خارج شد تا جایی که در روزهای پایانی صددرصد موشک‌های ایرانی بدون تقابل پدافند اسرائیلی به اهداف مورد نظر اصابت کرد.

این رویه باعث شد آمریکا و اسرائیل برای برقراری آتش‌بس سراسیمه عمل کنند و با تشدید حملات و پیوستن آمریکا به این تجاوز، ایران را به برقراری آتش‌بس متقاعد کنند.